與白色彗星帝國(guó)作戰(zhàn)三年后——為了拯救瀕臨滅亡的加米拉斯民族，戴斯拉總統(tǒng)繼續(xù)探索新的母星，最終在銀河的一處找到了符合條件的行星。但是，那里是強(qiáng)大的星際國(guó)家的領(lǐng)土范圍內(nèi)。在銀河中爆發(fā)的領(lǐng)土紛爭(zhēng)，導(dǎo)致與加米拉斯締結(jié)安全保障條約的地球被無情地卷入到了其中。給地球帶來軍事、經(jīng)濟(jì)優(yōu)越性的時(shí)間斷層技術(shù)，以自己的生命為代價(jià)而消失了——雖然被自責(zé)的念頭驅(qū)使著，但依舊擔(dān)任著大和號(hào)新艦長(zhǎng)的古代進(jìn)，為了應(yīng)對(duì)即將到來的事件，和新船員們一起開始了航海訓(xùn)練。卻也不知道其中混進(jìn)了什么人在盯著自己。盡管如此還是要“活下去”在從未有過的不安時(shí)代，大和號(hào)迎來了新的旅程。在那前方，有著超乎想象的新敵人在等待著他們……